Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSME1Q06323 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms