Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARDQ03181 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms