Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms