Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms