Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P62684 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms