Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN15P56746 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms