Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA4P51532 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms