Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms