Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms