Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PLNP26678 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms