Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VARSP26640 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VARSP26640 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms