Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRDP23468 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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