Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT1P21579 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT1P21579 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT1P21579 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT1P21579 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT1P21579 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT1P21579 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT1P21579 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT1P21579 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT1P21579 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT1P21579 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT1P21579 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT1P21579 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT1P21579 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT1P21579 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT1P21579 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT1P21579 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT1P21579 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT1P21579 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT1P21579 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYT1P21579 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYT1P21579 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT1P21579 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT1P21579 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT1P21579 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT1P21579 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT1P21579 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT1P21579 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT1P21579 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms