Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR2CP19387 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms