Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF3P18847 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATF3P18847 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATF3P18847 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF3P18847 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms