Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CTRB1P17538 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CTRB1P17538 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CTRB1P17538 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CTRB1P17538 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CTRB1P17538 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CTRB1P17538 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CTRB1P17538 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CTRB1P17538 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CTRB1P17538 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CTRB1P17538 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CTRB1P17538 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CTRB1P17538 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CTRB1P17538 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CTRB1P17538 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTRB1P17538 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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