Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCK1P16333 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCK1P16333 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCK1P16333 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms