Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms