Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms