Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 EHBP1-219ENST00000494958 1127 ntTSL 1 (best)5.42□□□□□ -1.548e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HPRT1-203ENST00000475720 599 ntTSL 35.42□□□□□ -1.548e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MIA3-208ENST00000475451 552 ntTSL 35.4□□□□□ -1.558e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.558e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MARCH5-203ENST00000467521 749 ntTSL 35.39□□□□□ -1.558e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PIKFYVE-205ENST00000422495 792 ntTSL 55.37□□□□□ -1.558e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HAUS1-211ENST00000593165 1079 ntTSL 55.36□□□□□ -1.558e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.558e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PBRM1-211ENST00000423351 4385 ntTSL 55.35□□□□□ -1.558e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RAP1GDS1-221ENST00000515187 496 ntTSL 35.35□□□□□ -1.558e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.558e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.558e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.558e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.568e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.568e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AL365259.1-202ENST00000427852 475 ntTSL 35.32□□□□□ -1.568e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 THAP12-204ENST00000529901 6795 ntTSL 1 (best)5.29□□□□□ -1.568e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KPNA1-204ENST00000466923 3316 ntTSL 25.28□□□□□ -1.568e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.568e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TUSC3-202ENST00000503191 731 ntTSL 35.27□□□□□ -1.578e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 UBAP2-207ENST00000421278 833 ntTSL 55.25□□□□□ -1.578e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.578e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.578e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.578e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PBRM1-215ENST00000446103 3256 ntTSL 25.21□□□□□ -1.588e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LVRN-209ENST00000514509 2354 ntTSL 25.21□□□□□ -1.588e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PWWP2A-204ENST00000521424 734 ntTSL 25.21□□□□□ -1.588e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.588e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ERC1-215ENST00000543263 513 ntTSL 35.17□□□□□ -1.588e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HAUS1-210ENST00000592471 357 ntTSL 55.13□□□□□ -1.598e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.598e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SGK1-210ENST00000474427 5474 ntTSL 25.09□□□□□ -1.598e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 UBE2Q2-206ENST00000563966 538 ntTSL 35.09□□□□□ -1.598e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BAZ2B-212ENST00000482503 1670 ntTSL 55.08□□□□□ -1.68e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.68e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.68e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TTLL7-209ENST00000480174 7828 ntTSL 1 (best)5.07□□□□□ -1.68e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PCCA-214ENST00000637358 1533 ntTSL 55.04□□□□□ -1.68e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.68e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 UBE2G1-205ENST00000574059 569 ntTSL 45.04□□□□□ -1.68e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ANKIB1-202ENST00000413588 642 ntTSL 35.03□□□□□ -1.68e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.68e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.618e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 METTL8-210ENST00000460539 677 ntTSL 35.02□□□□□ -1.618e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 UBE3D-202ENST00000369746 2740 ntTSL 1 (best)5.01□□□□□ -1.618e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DOCK7-209ENST00000614472 1982 ntTSL 55□□□□□ -1.618e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.618e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.618e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PRMT3-206ENST00000529592 4159 ntTSL 24.98□□□□□ -1.618e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZFPM2-AS1-203ENST00000520078 500 ntTSL 24.97□□□□□ -1.618e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.611e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 UBE2Q2-202ENST00000426727 2158 ntTSL 1 (best)4.96□□□□□ -1.628e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SRI-208ENST00000488015 588 ntTSL 24.96□□□□□ -1.628e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 EMC3-AS1-206ENST00000440568 558 ntTSL 44.95□□□□□ -1.628e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CREB1-217ENST00000494983 754 ntTSL 34.94□□□□□ -1.628e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AFTPH-206ENST00000487769 793 ntTSL 54.93□□□□□ -1.628e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CA5B-205ENST00000474624 565 ntTSL 54.93□□□□□ -1.628e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.628e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ARG2-204ENST00000557319 627 ntTSL 24.9□□□□□ -1.638e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.638e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AFTPH-203ENST00000409183 1874 ntTSL 24.89□□□□□ -1.638e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 USP54-206ENST00000433394 600 ntTSL 54.88□□□□□ -1.638e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CAMSAP2-204ENST00000447701 673 ntTSL 44.87□□□□□ -1.638e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.638e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZRANB2-AS2-233ENST00000628797 750 ntTSL 54.83□□□□□ -1.648e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.648e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HACD3-203ENST00000561763 483 ntTSL 34.81□□□□□ -1.648e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ATF7IP-206ENST00000535179 746 ntTSL 34.81□□□□□ -1.648e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.648e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.658e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.658e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLC2A14-209ENST00000536594 543 ntTSL 54.74□□□□□ -1.658e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LRRFIP1-214ENST00000489603 531 ntTSL 34.73□□□□□ -1.658e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ECHDC1-204ENST00000368292 854 ntTSL 54.7□□□□□ -1.668e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.7□□□□□ -1.668e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 THAP12-202ENST00000525277 621 ntTSL 24.7□□□□□ -1.668e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TIA1-209ENST00000474699 686 ntTSL 24.69□□□□□ -1.668e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ARHGAP21-205ENST00000418033 590 ntTSL 44.69□□□□□ -1.668e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.668e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LINC00922-202ENST00000568492 844 ntTSL 1 (best)4.68□□□□□ -1.668e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.668e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 THAP12-205ENST00000531878 537 ntTSL 34.67□□□□□ -1.668e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BTBD10-211ENST00000532261 560 ntTSL 44.66□□□□□ -1.668e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BBX-208ENST00000425868 550 ntTSL 44.66□□□□□ -1.668e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PPCDC-204ENST00000563298 476 ntTSL 54.65□□□□□ -1.678e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BBX-205ENST00000413213 819 ntTSL 54.57□□□□□ -1.688e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BPTF-204ENST00000342579 4041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)4.57□□□□□ -1.688e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.688e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C11orf72-202ENST00000446232 1126 ntTSL 1 (best)4.55□□□□□ -1.688e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.688e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LVRN-207ENST00000512314 2067 ntTSL 24.52□□□□□ -1.698e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TBCK-217ENST00000510927 2826 ntTSL 24.52□□□□□ -1.698e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 UHRF2-211ENST00000484159 3112 ntTSL 24.51□□□□□ -1.698e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PAX6-213ENST00000464174 846 ntTSL 54.51□□□□□ -1.698e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NAPG-204ENST00000580746 743 ntTSL 24.51□□□□□ -1.698e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PIP5K1C-207ENST00000636612 153 ntTSL 54.48□□□□□ -1.698e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.698e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CASP8-210ENST00000424461 308 ntTSL 54.46□□□□□ -1.698e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ECHDC1-211ENST00000460558 301 ntTSL 54.46□□□□□ -1.698e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TRDMT1-202ENST00000354631 8230 ntTSL 1 (best)4.43□□□□□ -1.78e-6■■■■■ 107
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