Protein–RNA interactions for Protein: O60671

RAD1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD1O60671 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD1O60671 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD1O60671 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD1O60671 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms