Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC28A2O43868 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms