Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX3O43711 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms