Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms