Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TO15178 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TO15178 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TO15178 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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