Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F3O00716 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E2F3O00716 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms