Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms