Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DXG7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DXG7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms