Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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