Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL33A6NCF5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms