Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHORDC1Q9UHD1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms