Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms