Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3BQ9P1U1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms