Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms