Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms