Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms