Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms