Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms