Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
C1orf50Q9BV19 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms