Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF3RQ99062 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms