Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms