Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms