Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF21BQ96EK2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF21BQ96EK2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms