Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms