Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG2BQ96BY7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms