Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms