Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3CQ92520 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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