Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms