Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms