Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H3F3CQ6NXT2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms